Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vmn1r68E9Q0V3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r68E9Q0V3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r68E9Q0V3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms