Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E430018J23RikE9PZQ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E430018J23RikE9PZQ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E430018J23RikE9PZQ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E430018J23RikE9PZQ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E430018J23RikE9PZQ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E430018J23RikE9PZQ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E430018J23RikE9PZQ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms