Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rsph10bE9PYQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph10bE9PYQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph10bE9PYQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rsph10bE9PYQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsph10bE9PYQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsph10bE9PYQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsph10bE9PYQ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsph10bE9PYQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rsph10bE9PYQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph10bE9PYQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms