Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc175E9PVB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc175E9PVB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc175E9PVB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc175E9PVB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms