Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc24E9PUW8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc24E9PUW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc24E9PUW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc24E9PUW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc24E9PUW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc24E9PUW8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms