Protein–RNA interactions for Protein: D3YZG8

Mthfd2l, Probable bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd2lD3YZG8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mthfd2lD3YZG8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mthfd2lD3YZG8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mthfd2lD3YZG8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mthfd2lD3YZG8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mthfd2lD3YZG8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd2lD3YZG8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd2lD3YZG8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd2lD3YZG8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mthfd2lD3YZG8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd2lD3YZG8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms