Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam47eD3YWC7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam47eD3YWC7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam47eD3YWC7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam47eD3YWC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam47eD3YWC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms