Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnyl1D3YUJ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnyl1D3YUJ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnyl1D3YUJ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnyl1D3YUJ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnyl1D3YUJ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnyl1D3YUJ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnyl1D3YUJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnyl1D3YUJ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnyl1D3YUJ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnyl1D3YUJ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnyl1D3YUJ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnyl1D3YUJ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms