Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprz1B9EKR1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprz1B9EKR1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptprz1B9EKR1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptprz1B9EKR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprz1B9EKR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptprz1B9EKR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms