Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cped1B2RX70 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cped1B2RX70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cped1B2RX70 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cped1B2RX70 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cped1B2RX70 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cped1B2RX70 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cped1B2RX70 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cped1B2RX70 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cped1B2RX70 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cped1B2RX70 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms