Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nipsnap3aB1AWZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipsnap3aB1AWZ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms