Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pramef20B1ARV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramef20B1ARV6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef20B1ARV6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef20B1ARV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef20B1ARV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef20B1ARV6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef20B1ARV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef20B1ARV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef20B1ARV6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms