Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap221A9Q751 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap221A9Q751 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap221A9Q751 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap221A9Q751 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap221A9Q751 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap221A9Q751 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap221A9Q751 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms