Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pm20d2A3KG59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pm20d2A3KG59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pm20d2A3KG59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pm20d2A3KG59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pm20d2A3KG59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms