Protein–RNA interactions for Protein: A2RRY9

4930595M18Rik, RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595M18RikA2RRY9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930595M18RikA2RRY9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930595M18RikA2RRY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930595M18RikA2RRY9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4930595M18RikA2RRY9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930595M18RikA2RRY9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930595M18RikA2RRY9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930595M18RikA2RRY9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930595M18RikA2RRY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930595M18RikA2RRY9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.9 ms