Protein–RNA interactions for Protein: A2AWL3

AV320801, Expressed sequence AV320801, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AV320801A2AWL3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AV320801A2AWL3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AV320801A2AWL3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AV320801A2AWL3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AV320801A2AWL3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AV320801A2AWL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AV320801A2AWL3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AV320801A2AWL3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AV320801A2AWL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms