Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms