Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms