Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms