Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv26A0A0B4J1P5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv26A0A0B4J1P5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv26A0A0B4J1P5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv26A0A0B4J1P5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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