Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNP1

Gm28168, Predicted gene 28168, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28168A0A087WNP1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28168A0A087WNP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28168A0A087WNP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28168A0A087WNP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28168A0A087WNP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28168A0A087WNP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28168A0A087WNP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28168A0A087WNP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28168A0A087WNP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms