Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms