Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms