Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn3Q9Z0G9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn3Q9Z0G9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms