Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms