Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec2Q9WV35 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms