Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms