Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms