Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip1Q9JJ57 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms