Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms