Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod3Q9JHJ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Tmod3Q9JHJ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Tmod3Q9JHJ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Tmod3Q9JHJ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Tmod3Q9JHJ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod3Q9JHJ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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