Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf23Q9ER63 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf23Q9ER63 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms