Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms