Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms