Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn4Q9D6I3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn4Q9D6I3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn4Q9D6I3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn4Q9D6I3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms