Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nol3Q9D1X0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms