Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CXL3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms