Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms