Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms