Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rab5aQ9CQD1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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