Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029P11RikQ9CQ68 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms