Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc198Q9CPZ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc198Q9CPZ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc198Q9CPZ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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