Protein–RNA interactions for Protein: Q99N57

Raf1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raf1Q99N57 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raf1Q99N57 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Raf1Q99N57 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raf1Q99N57 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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