Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms