Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hoxc12Q8K5B8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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