Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rbm48Q8K2X2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm48Q8K2X2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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