Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf17Q8CFA7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms