Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwc2Q8C8N3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms