Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z96

Vangl1, Vang-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl1Q80Z96 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vangl1Q80Z96 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms