Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eri1Q7TMF2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eri1Q7TMF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms